信息安全管理體系文件編制完成以后，組織應(yīng)按照文件的控制要求進(jìn)行審核與批準(zhǔn)，并發(fā)布實(shí)施，至此，信息安全管理體系將進(jìn)入運(yùn)行階段。體系運(yùn)行初期一般稱為試運(yùn)行期或磨合期，在此期間體系運(yùn)行的目的是要在實(shí)踐中檢驗(yàn)體系的充分性、適用性和有效性。在體系運(yùn)行初期，組織應(yīng)加強(qiáng)運(yùn)作力度，通過實(shí)施其手冊、程序和各種作業(yè)指導(dǎo)性文件等一系列體系文件，充分發(fā)揮體系本身的各項(xiàng)功能，及時(shí)發(fā)現(xiàn)體系策劃本身存在的問題，找出問題根源，采取糾正措施，糾正各種不符合，并按照更改控制程序要求對體系予以更改，以達(dá)到進(jìn)一步完善信息安全管理體系的目的。
有針對性地宣貫信息安全管理體系文件。
體系文件的培訓(xùn)工作是體系運(yùn)行的首要任務(wù)，培訓(xùn)工作的質(zhì)量直接影響體系運(yùn)行的結(jié)果。組織應(yīng)根據(jù)培訓(xùn)工作計(jì)劃的安排并按照培訓(xùn)程序的要求對全體員工實(shí)施培訓(xùn)。通過培訓(xùn)使全體員工認(rèn)識到新建立或完善的信息安全管理體系是對過去信息安全管理體系的變革，是為了向國際先進(jìn)的信息安全管理標(biāo)準(zhǔn)接軌，要適應(yīng)這種變革和新管理體系的運(yùn)行，就必須認(rèn)真學(xué)習(xí)、貫徹信息安全管理體系文件。
實(shí)踐是檢驗(yàn)真理的唯一標(biāo)準(zhǔn)。
體系文件通過試運(yùn)行必然會出現(xiàn)一些問題，全體員工應(yīng)將實(shí)踐中出現(xiàn)的問題和改進(jìn)意見如實(shí)反饋給有關(guān)部門，以便采取糾正措施。
將體系試運(yùn)行中暴露出的問題，如體系設(shè)計(jì)不周、項(xiàng)目不全等進(jìn)行協(xié)調(diào)、改進(jìn)。
信息安全管理體系的運(yùn)行涉及組織體系范圍的各個(gè)部門，在運(yùn)行過程中，各項(xiàng)活動往往不可避免的發(fā)生偏離標(biāo)準(zhǔn)的現(xiàn)象，因此，組織應(yīng)按照嚴(yán)密、協(xié)調(diào)、高效、精簡、統(tǒng)一的原則，建立信息反饋與信息安全協(xié)調(diào)機(jī)制對異常信息反饋和處理，對出現(xiàn)的問題加以改進(jìn)，并保證體系的持續(xù)正常運(yùn)行。
加強(qiáng)有關(guān)體系運(yùn)行信息的管理，不僅是信息安全管理體系試運(yùn)行本身的需要，也是保證試運(yùn)行成功的關(guān)鍵。
所有與信息安全管理體系活動有關(guān)的人員都應(yīng)按體系文件要求，做好信息安全的信息收集、分析、傳遞、反饋、處理和歸檔等工作。
信息安全體系文件屬于組織的信息資產(chǎn)，包含有關(guān)組織的全部安全管理等敏感信息，組織應(yīng)按照信息分類的原則對其進(jìn)行分類、進(jìn)行密級標(biāo)注并實(shí)行嚴(yán)格的安全控制，未經(jīng)授權(quán)不得隨意復(fù)制或借閱。